一位年迈的老警察深信在他小镇上被捕的神秘陌生人是无辜的，进而展开的调查就像捅了马蜂窝一样，将永远改变这个镇子。

医学界的新秀伊丽莎白·伯恩医师是研究生物分子医学的菁英，受到医疗权威沃尔顿博士的赏识，邀请她加入研究小组，此时正逢伯恩的母亲罹患重症，为了帮助母亲，她便答应加入了这个名为“普罗米修斯”的研究计划，其目的是研究出干细胞再生…

所有的一切，都开始于上一集故事的结局处，随即就以旋风般的姿态展开了一场全新的血雨腥风……看起来安静从容但暴躁易怒的玛丽贝丝（丹妮尔·哈丽丝饰）正坐在一艘陷在路易斯安那州的沼泽地的小木船里，强烈的求生欲望让她拼了命地想逃离…

在原电影事件发生十年后，Victor Crowley被错误地复活，再次杀人。