对橘纯一（前野智昭 配音）来说，能够默默的观望着前辈森岛遥（伊藤静 配音）的背影已经是一种莫大的幸福，可是随着毕业季的临近，橘纯一发现，对前辈的感情已经到了不说不行的地步，否则，他将永远失去这宝贵的机...

20世纪末，15岁的少年榊原恒一（阿部敦 配音）由于父亲前往海外公干的原因，于是来到亡母的家乡夜见山市，暂住阿姨三神怜子（宮牧美沙代 配音）家中等待转入新的学校。在此期间，他的旧病复发，入院治疗，某晚，恒一在空荡荡的走廊内邂逅…

江户时代末期（本作的20年前），被称为“天人”（あまんと）的谜之异星人来袭。于是地球人与天人之间的战争瞬即爆发，为数众多的武士和攘夷派志士都参与与天人的战斗。幕府见识到天人强大的实力后，最终向天人低头，放弃武士不管，擅自与…

本作的故事主要围绕追逐梦想的五名女生——宫森葵，安原绘麻，坂木静香，藤堂美沙，今井绿展开，是一部描写以白箱的完成为目标而奋斗的她们，每天遇到的麻烦以及策划工作时碰到的纠葛与挫折，还有制作组在制作作品时的团结和冲突的动画业…

魔女即是光。是将威胁人们的魔兽予以净化之人。 并且，是传递希望歌声之人。 芙罗拉女学院，就是培养这些魔女们的学校。 她们有一个梦想。 总有一天要拯救人们，并将笑容传递给他们。 「那边的世界的魔女，是叫做偶像来着？」来自异世界…

《摇曳百合·第三季》将继续续写娱乐部的四人（京子，结衣，千夏，灯里）和学生会诸位成员（无口会长松本理世，傲娇副会长杉浦绫乃，妄想鼻血女池田千岁，冒失傻妞大室樱子。。。