故事发生在几十年才会出现在海上一次的传说之岛——蓬莱岛上，这里管事的是以龙罗为主的号称“四斗神”的兄弟帮派。在龙罗之下，有他二弟凶罗、三弟兽罗和四弟刚罗，在他们的统治下，岛上一片黑暗。不仅如此，在蓬莱岛上还囚禁着一群半妖…

日暮篱是个普通的国三学生，同时是神社的女儿。她在十五岁生日的那天突然闯入了时光隧道，回到了五百年前的日本战国时代，并与被封印于神木的半妖「犬夜叉」相遇。当时犬夜叉正打算靠「四魂之玉」的力量，让自己成为真正的妖怪。但是什么…

50年只出现一次的传说之岛“蓬莱岛”。曾经，犬夜叉想和桔梗一起从统治蓬莱岛的四斗神手中救下岛上仅存的蓝等半妖小孩，但在仅差一步的关头，岛就突然消失了……50年后——这座蓬莱岛再次在这个世界出现。犬夜叉他们到达蓬莱岛，为了解开…

并称为“天下霸道三剑”的天生牙、丛云牙和铁碎牙分管天、地、人三界，当年全部为犬夜叉的父亲斗牙王所拥有。斗牙王与人类公主十六夜相恋，生下犬夜叉，此举惹来暗恋十六夜的武将刹那猛丸的嫉妒。身负重伤的斗牙王用天生牙救活被猛丸杀死…

邪恶的奈落与犬夜叉一行的战争愈演愈烈，为了保护心脏不受伤害，他在白灵山分离出一个能洞察人类心灵的婴儿，并将心脏托其保管。在此之后，婴儿被某高僧砍作两半，变成白童子和赤子。当得知奈落心脏的重要性时，这两个同样邪恶的童子决定…

犬夜叉的父亲犬大将是一个优秀的大妖怪，拥有强大妖力的西国犬王。而犬夜叉的妈妈，则是人类的公主十六夜，柔弱却也坚强。也许犬夜叉不喜欢别人提起他妈妈的原因，便是半妖这回事吧。犬夜叉对自己半妖的身份一直很忌讳，是因为，半妖本就…

正在读初中三年级的女生——日暮戈薇是一名家住在神社的普通女孩子。15岁生日那天，被妖怪──百足妖妇拖入神社的枯井中，来到了500年前的日本战国时代，并与已被封印的半妖——犬夜叉相遇。犬夜叉自称是为得到四魂之玉以成为真正的妖怪…