《山海宝贝》主要讲述神龙及其他诸神后代共99名神兽为了竞选图腾，被派遣到人界历炼时迸发的各种光怪陆离、令人捧腹的故事。

海宝是彩虹城的守护者，是帮助人类的精灵，有超能力，能够解救人类，看上去憨厚可爱，实则大智若愚。有一天，玩偶星球派来了破坏者丑丑，作为彩虹城的守护者，海宝与丑丑展开了战斗，这是故事中一对主要的冲突角色。但丑丑并不是简单的反…

不周镇接连出现新的神兽和与之结印的少年，为了争夺图腾之位以及成为人间的霸主，双方达成结印协议，并对小炫炎吉等人宣战，进行图腾的角逐。在与其他神兽和结印少年争斗的过程中，小炫炎吉等人也结识了更多的伙伴，在经历了各种磨砺后，…

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在山海经中记录着千奇百怪的奇珍异兽，人们称之为神兽。虽为传说，但这些神兽却是真实存在的，只是不知为什么一直没有被人类所发现。直到有一天，不周镇的热血少年小炫遇到了一只会喷火的怪兽，神兽又重新出现在了人类的视野中。随之而来…