与剧场版比克提尼与黑英雄捷克罗姆同时上映，为了成为合格的神奇宝贝训练师，小智、天桐、艾莉丝带着各自的小伙伴继续在世界各地旅行。这次他们来到了美丽的山中小镇艾茵多奥克参加神奇宝贝的比赛，在比赛的时候，小智多次得到一个神秘的…